Сейчас учреждение находится на балансе Росгидромета, но вскоре ситуация может поменяться. На днях Георгий Полтавченко обсуждал этот вопрос с директором музея Виктором Боярским и предложил перевести учреждение на баланс города. Известно также, что пока этот вопрос не будет решён, музей будет находиться в том же помещении, в котором находится сейчас.

Проработкой этого вопроса будет заниматься вице-губернатор Василий Кичеджи. Также известно, что в Северную столицу могут переместить знаменитый ледокол «Арктика», который сейчас прописан в Мурманске, но для него ещё нужно найти подходящую стоянку. Если это будет сделано, то ледокол может стать филиалом музея Арктики и Антарктики.

Напомним, что музей располагается в здании бывшей Никольской единоверческой церкви, которая была построена в начале 19 века в стиле позднего ампира. Но в 1931 году церковь закрыли, а шесть лет спустя в её здании расположился музей.